□ 洪武十年（1377），重建同安天兴寺。

□ 同年，住持僧无为禅师及其弟子智性法师合力募资重建同安梵天寺。

□ 洪武十至二十年间（1377－1387），洪济山上始建方广寺；后改云顶岩。上有洪武十四年名人题刻“天际”两字，为鹭岛诸山发现年代最早题刻；是为鹭岛第一座僧建寺岩。（僧号未详，待考）。

□ 洪武十八年（1385），同安天兴寺僧觉光和尚，燃指断臂倡修苦行，被县官视为异端，流放鹭岛，居五老峰下宋僧旧址无尽岩。于岩壁亲题“息心断臂”四字，以明心志。后得陈氏家族资助，于无尽岩下（今南普陀寺法堂）兴建普照寺，是为鹭岛僧建第一座寺院。

□ 洪武二十四年（1391），僧雪峰重建同安真寂寺。

□ 洪武二十七年（1394），在嘉禾屿建造中左千户所城，以防海寇骚扰。

□ 洪武年间（1368—1398），宋理学家邵雍十三代孙邵亨购买同安西山，重兴白云岩。

□ 永乐年间（1403—1424），僧志和重修天兴寺，后废。

□ 永乐十三年（1415），月照禅师开辟万寿岩，创建佛教道场。

□ 永乐年间（1403—1424），圆镜禅师大规模拓建厦门禾山觉性院，常住僧九十余人。

□ 成化年间（1465—1487），梵天寺僧定波禅师就天兴寺废址上建精舍住修，至正德年间（1506—1521）又被县官赵汝弼拆毁，改建粮仓。

□ 嘉靖年间（1522—1566），进士陈健于同安宫田社（今属大同镇）创建西园院，以供其妹出家静修。

□ 嘉靖，隆庆年间（1522—1572），浙江按察副使刘存德之弟刘存业捐地扩建同安梅山寺。

□ 万历十一年（1583），厦门乡宦池浴德开拓醉仙岩，于岩下“醴泉洞”侧建“九仙祠”，祀何氏九仙。后就岩改天界寺。

□ 万历十四年（1586），有僧在日光岩下依岩结庵住修，称莲花庵。

□ 万历三、四十年间（1602—1612），名士林懋时于玉屏山挖石穿洞，先在山南开凿白鹿洞，后向山背进展，于虎溪岩开凿“稜层”、“摹天”、“虎口”诸洞，手书“稜层”、“摹天”大字，并亲自架梯摩刻洞额。

□ 万历三十九年（1611），同安知县李春开捐资募修西山白云岩。

□ 万历四十三年（1615），名士池显方在玉屏山上建玉屏寺，与山僧谈禅论道，后改称“虎溪岩”。

□ 万历四十八年（1620），同安县学诸生曾追芳在城西北肇建开年寺，后废。

□ 万历年间（1573—1620），寺僧雾云在普照寺上侧建碧泉岩（又称石室岩），明末清初废。

□ 万历年间（1573—1620），有道士建太平观。清乾隆年间（1736—1795），南普陀寺如渊和尚改道观为佛教道场，称太平岩

□ 万历年间（1573－1620），有挥尘和尚于白鹤岭下开建白鹤岩，是为该岩开山一世祖。

□ 崇祯年间（1628—1644），厦门普照寺因寺租流失开始衰败，据崇祯十三年（1640）太常寺卿林宗载《田租入寺志》记载，普照寺至断臂禅师时“租乃大旺”，后因“农田水租多入豪右”，租入不足以供国课，因而香灯不继，当时住持僧了蕴几乎要弃寺而去。林氏乃将其子所购寺租田种一石八斗献归寺方，并立碑以志其事。

□ 明末，有吴姓善士于吴仓社后山下掘地得宝，发愿建寺祀佛，因建宝山岩。

□ 明末，泉州开元寺僧明任从安溪卓锡厦门，住半山堂（即今寿山岩）。明任善行草大字，工诗，与厦门名士纪许国等友善往来，纪许国有诗记其事。

□ 明末，僧维信师祖向定远侯郑联募地创建万石岩。