又称大岩寺。在海沧区大岩山中。寺宇面江背麓，地灵磅礴。宋人以登斯岩如到彼岸，因建寺崇祀三宝观音。元大德四年（1300）大修，匾曰“云塔寺”，乃以其山巅岩石似塔，高薄云霄，故名。寺前建讲堂，明柯凤翔、周尔发二人曾先后在此奋发读书，皆高中进士，柯凤翔历两浙转运使，周尔发官终南京府丞，均以勋名气节垂光史册。附近叶、谢、杨、林、李诸姓登高第、膺厚秩，代不乏人，时人由是推崇云塔寺观世音灵应。清代，栋宇圮毁，间有里人募资修葺。至同治年间（1862—1874），因年久失修，殿堂荡然无存，周围谢、杨、李、邱、林诸姓乡人相与踊跃劝捐，重新翻建，并扩大规模，左增翼丈室、经楼，寺前讲堂仍旧址重建，左右加翼四室，焕然一新，足壮观瞻，香火复盛。岩寺近年重修，由居士管理。清同治《重兴云塔寺碑记》与另一段旧碑树立于寺前。2002年厦门佛教协会在寺后营建佛教火葬炉，作为厦门佛门弟子焚化尸骨火葬之所。